| 1 | Facultad de Medicina | IIBISMED-Instituto de Investigaciones Biomédicas | IIBISMED |
| 2 | Facultad de Ciencias y Tecnología | FCyT-Centro de Aguas y Saneamiento Ambiental | CASA |
| 3 | Facultad de Ciencias y Tecnología | FCyT-Centro de Alimentos y Productos Naturales | CAPN |
| 4 | Facultad de Ciencias y Tecnología | FCyT-Centro de Biodiversidad y Genética | CBG |
| 5 | Facultad de Ciencias y Tecnología | FCyT-Centro de Información de Recursos Hídricos | LHUMSS |
| 6 | Facultad de Ciencias y Tecnología | FCyT-Centro de Biotecnología | CBT |
| 7 | Facultad de Ciencias y Tecnología | FCyT-Laboratorio de Geotecnia | GTUMSS |
| 8 | Facultad de Ciencias y Tecnología | FCyT-Centro de Tecnología Agroindustrial | CTA |
| 9 | Facultad de Ciencias y Tecnología | FCyT-Educación Asistida por Computador | CAE |
| 10 | Facultad de Ciencias y Tecnología | FCyT-Programa ELEKTRO | ELEKTRO |
| 11 | Facultad de Ciencias y Tecnología | FCyT-Instituto de Investigaciones de la Facultad de Ciencias y Tecnología | IIFCyT |
| 12 | Facultad de Odontología | FO-Instituto de Investigaciones de Odontología | IIO |
| 13 | Dirección de Investigación Científica Tecnológica | DICyT-Instituto de Investigaciones Antropológicas y Museo | INIAM |
| 14 | Dirección de Investigación Científica Tecnológica | DICyT-Centro de Estudios de Población | CEP |
| 15 | Facultad de Arquitectura | FAyCH-Instituto de Investigaciones de Arquitectura | IIA |
| 16 | Facultad de Ciencias Agrícolas, Pecuarias, Forestales y Veterinarias | FCAPFyV-Agroecología Universidad Cochabamba | AGRUCO |
| 17 | Facultad de Ciencias Agrícolas, Pecuarias, Forestales y Veterinarias | FCAPFyV-Centro Andino para la Gestión y Uso del Agua | AGUA |
| 18 | Facultad de Ciencias Agrícolas, Pecuarias, Forestales y Veterinarias | FCAPFyV-Centro de Investigación en Forrajes La Violeta | CIF |
| 19 | Facultad de Ciencias Agrícolas, Pecuarias, Forestales y Veterinarias | FCAPFyV-Centro de Investigación, Formación y Extensión en Mecanización Agrícola | CIFEMA |
| 20 | Facultad de Ciencias Económicas | FCE-Centro de Planificación y Gestión | CEPLAG |
| 21 | Facultad de Ciencias Económicas | FCE-Instituto de Estudios Sociales y Económicos | IESE |
| 22 | Facultad de Ciencias Jurídicas y Políticas | FCJyP-Instituto de Investigaciones Ciencias Jurídicas y Políticas | IIJyP |
| 23 | Vicerrectorado | Vice-Centro de Estudios Superiores Universitarios | CESU |
| 24 | Facultad de Ciencias y Tecnología | FCyT-Centro de Estadística Aplicada | CESA |
| 25 | Facultad de Desarrollo Rural y Territorial | FDRyT-Instituto de Investigaciones de la Facultad de Desarrollo Rural y Territorial | ex ETSA |
| 26 | Facultad de Ciencias Agrícolas, Pecuarias, Forestales y Veterinarias | FCAPFyV-Instituto de Investigaciones FCAPFyV – Escuela Superior Forestal | ESFOR |
| 27 | Facultad de Ciencias y Tecnología | FCyT-Centro de Desarrollo de Tecnologías de Fabricación | PDTF |
| 28 | Facultad de Ciencias y Tecnología | FCyT-Mejoramiento de la Enseñanza de la Matemática e Informática | MEMI |
| 29 | Vicerrectorado | Vice-Centro de Levantamientos Aeroespaciales y Aplicaciones SIG | CLAS |
| 30 | Facultad de Sociología | FACSO-Instituto de Investigaciones de Ciencias Sociales | INCISO |
| 31 | Facultad de Humanidades y Ciencias de la Educación | FHyCE-Instituto de Investigaciones de Humanidades | IIHyCE |
| 32 | Facultad de Bioquímica y Farmacia | FByF-Instituto de Investigaciones Bioquímicas y Farmacéuticas | IIFCFyB |
| 33 | Facultad de Ciencias Agrícolas, Pecuarias, Forestales y Veterinarias | Instituto de Investigaciones de la Facultad de Agronomía | IIFCAPyV |
